Las emisiones en el sector Agricultura están relacionadas a las actividades agrícolas y pecuarias, concretamente a emisiones que provienen en su mayoría de los procesos de metanogénesis derivados de microrganismos en el proceso digestivo del ganado y de la aplicación de insumos orgánicos y fertilizantes nitrogenados al suelo de cultivos agrícolas. Estas fuentes de emisión, acorde a las Directrices del IPCC 2006, se categorizan con fines de cálculo en dos grupos agregados:
a) Emisiones del ganado o actividades pecuarias incluyendo fermentación entérica y el manejo de estiércol
b) Emisiones por uso del suelo agrícola e insumos aplicados, incluyendo fertilizantes orgánicos y sintéticos como urea y cal.